CNKI查重系统检测论文参考文献的原理主要是通过比对文献中的文字内容，识别其中的相似度和重复率。它会对论文中的参考文献进行全文检索，并与其数据库中的文献进行比对，通过算法判断文献之间的相似度，从而判定是否存在抄袭或重复引用的情况。该系统利用先进的文本比对技术，能够高效、准确地检测出文献中的重复内容，为学术论文的撰写提供了重要的参考依据。

CNKI查重系统检测论文参考文献的原理是基于文本比对技术，通过对文献内容的分析和匹配，判断文献之间的相似度和重复率。该系统采用了先进的算法，能够对文献中的文字进行精准的比对，识别出其中的重复、抄袭等问题。通过这一原理，CNKI查重系统可以帮助学术界和科研人员及时发现论文中的学术不端行为，维护学术道德，保障学术研究的公正性和严肃性。